Para ello, los órganos de control y certificación realizan controles exhaustivos a sus operadores, así como analíticas de los productos para detectar posibles residuos de pesticidas, antibióticos, organismos modificados genéticamente, aditivos y otras sustancias prohibidas.

En el caso del COPAE se trata de una certificación pública, por lo que los costes de certificación no suponen un inconveniente para los productores.

El COPAE se encuentra en fase de implantación de la Norma EN 45011 para acreditar que se cumplen los requisitos de funcionamiento de los organismos de certificación de producto y garantizar la imparcialidad e independencia en el proceso de certificación.